首先应排除功能性原因或其他疾病，确定是否有尿道炎存在。需要询问患者遵医嘱及性行为情况。如有尿道分泌物，需做悬滴片检查阴道毛滴虫，或加10%KOH检查真菌。持续性尿道炎应考虑到单纯疱疹病毒尿道炎的可能。仔细认真地检查以排除尿道异物、尿道内疣和尿道周围瘘管或脓肿。必要时，可以进行尿道镜检查或尿道造影以排除尿道狭窄、尿道内损害及肿瘤等。患者的性伴也需做相关微生物检测。对四环素耐药的解脲支原体可引起持续性非淋菌性尿道炎，可以改用红霉素进行治疗。

　　目前国际最新疗法：“基因疗法”彻底根治非淋菌性尿道炎

　　“基因疗法”的问世，规避传统治疗支原体、衣原体易复发弊端。“基因疗法”是目前由世卫组织和美国推荐使用治疗非淋菌性尿道炎的首选疗法，尤其对耐药、抗药的支原体和衣原体疗效显著。该疗法从基因分子生物学角度，对病变的源头进行控制，采用高效基因抗生素，发挥离子渗透效应，使药物分子直接快速渗透尿道组织，破坏病毒的基因生物链，迅速清除病原体，避免了传统抗生素药物治疗的耐药性，从而达到治愈不复发的目的。目前贵州省红十字会医院在省内率先采用“基因疗法”彻底根治非淋菌性尿道炎、非淋菌性宫颈炎、附件炎。贵州省红十字会医院泌尿科经临床治疗万例以上支原体、衣原体感染者，尤其对久治不愈和有严重并发症的患者，经治疗后多次检测均获得彻底治愈。