合肥友好医院科室齐全，泌尿科、妇科、不孕不育科为三大特色专科，同时设有内科、外科、妇产科、儿科、耳鼻咽喉科、口腔科、皮肤科、乳腺科、肛肠科、医学美容科、中医科、妇女保健科、麻醉科、医学检验科、医学影像科、急诊医学科、中西医结合科、预防保健科等30多个临床和医技科室。
合肥友好医院先后被授予从业人员健康证办理定点医院、省市医保定点医院、合肥市生育保险、合肥市计划生育免费服务定点医疗医院、工伤保险定点医院和肥东、肥西、长丰、寿县、庐江、定远、金寨等县新农合定点医院。
除此之外，医院还先后获得“爱婴医院”、“合肥市首批‘规范药房’医院”多次获得“合肥市疾病预防控制先进单位”、“合肥市医疗医院妇幼卫生目标管理综合考评先进单位”、“安徽省诚信民营医院”等多项荣誉称号。
合肥友好医院重视医资力量，长期聘用医学和主任医师坐诊。在各学科主任带领下探索新疗法、新技术，研究提高诊疗质量。还多次组织医技开发、研究和指导，开展各类疾病技术攻关，为保证患者健康打下了坚实的基础。
合肥友好医院先后从国内外引进了螺旋全身CT机、GE彩超、黑白B超、大型X光机、Gyrus等离子前列腺治疗系统、腹腔镜、宫腔镜、海扶超声聚焦刀、LEEP刀，全自动生化仪、肺功能监测仪等一系列先进诊疗设备，能进行全方位诊断和治疗各类疾病。
合肥友好医院作为医保定点医院，严格执行国家收费标准，杜绝诸如私立医院、诊所等随意抬高药品价格、乱收费、滥用药物等现象发生，平价不平质，全面保障患者权益。